초딩, 결핵 과학연구에 참여하다(4)

일반인이 시민과학자로 참여하는의약개발 시스템 - EteRNA 체험기

네 번째는 멀티 고리(Multiloop)다.

멀티 고리는 고리와 연결되어있는 줄로 된 염기쌍이 3개 이상 있다. 

그리고 줄로 된 염기쌍과 다른 줄로 된 염기쌍 사이에 결합하지 않은 염기쌍이 있거나 

아예 사이에 껴 있는 염기쌍이 없을 수도 있다. 

부스팅은 GA, CA 방법이 대표적이고, 이터나에서는 UU 방법은 효과가 없다고 설명했다.

다섯 번째는 부푼 염기쌍(Bulge)이다.

처음에 이걸 보았을 때 내부 고리와 무슨 차이점이 있는지 헷갈렸다.

멀티 고리를 제외한 다른 고리들은 고리와 연결된 줄과 줄 사이에 염기쌍이 하나 정도 있어야 한다.   

이 부푼 염기쌍은 내부 고리의 형태만 띨 뿐, 염기쌍 줄과 줄 사이가 띄워져 있지 않기 때문이다.

부푼 염기쌍은 트라이루프와 같이, 부스팅 자체가 불가능하다.

 

마지막으로는 외부 고리(External loop)이다. 

이 고리는 내부 고리와 반대로 염기쌍 줄과 줄이 이어져 있는 고리의 부분이 끊어져 있다.

내가 이해한 바로는, 이 고리도 내부 고리와 비슷한 방법으로 부스팅을 하면 되는 것으로 알고 있다. 그리고 똑같은 염기쌍(UU재외)을 이용해 부스팅을 하면 효과가 없다.