바이오 및 생물정보 동향 (2016-1001호)
Bioinformatics Issues
바이오 및 생물정보 동향 (2016-1001호) #
10월은 가을의 향기와 아름다운 단풍이 물든 풍요로운 결실의 기간이었습니다.
2016년 인실리코젠, KOBIC 제 34회 교육이 결실을 거두며 한해의 교육이 마무리 되었습니다.
네이처에 혹평을 받으며 한국인 유전체 해독이 정확하게 되기도 하였고, 아프리카발톱개구리의 유전체도 해독외에 네이처에 발표되었습니다.
바이오분야에서는 지난 9월 정밀의료 관심에 이어서 여러 대학병원들이 차세대 먹거리 사업으로 헬스케어 사업에 주목한다는 기사와, 게놈프로젝트에 한국이 뒤쳐졌던 지난 일을 반성하면서 뇌과학 지도 연구개발에 주력을 기울인다는 기사도 있엇습니다.
한편, 홍채인식이라는 신기술로 관심을 모았던 삼성 갤럭시노트 7 단종이 전세계적으로 이슈가 되었던 기간이기도 하였습니다.
키워드로 보는 10월 동향: KOBIC 차세대 생명정보 교육, 에피지노믹스, 한국인 및 아프리카발톱 유전체 해독 네이처 발표, 헬스케어 사업, 갤럭시노트7
유전체 및 생물정보 이슈 #
[이슈]
한국인 유전체 완벽 해독..."세계에서 가장 정확"
• 현재까지 나온 인류 유전체 해독 결과를 통틀어 가장 적확하다는 평가
• 서정선 서울대 의대 유전체의학연구소장과 국내 생명공학기업인 마크로젠의 연구진 등은 한국인의 유전체 서열을 거의 완벽하게 해독
• 국제학술지인 '네이처' 10월 6일자에 '특집 논문'으로 게재
• 한국인 염기 서열을 기존 100배 길이로 정확하게 읽어내는 기법을 적용해 공백으로 남았던 유전체 정보 190곳 가운데 절반이 넘는 105곳을 완전히 해독
• 이와 함께 한 사람이 어머니와 아버지로부터 각각 어떤 유전자를 받았는지도 구분하는 성과도 창출
• 한국인의 유전체를 해독하며 암 억제 유전자와 피부색 관련 유전자 등 다양한 유전자에서 한국인만의 특성이 있는 것을 찾아냄
[오피니언]
• 개인의 유전체 정보를 바탕으로 질병을 예측하고 진단하며 치료하는 정밀의학의 기술적 주도권을 한국이 선점했다는데 이번 연구의 의의
• 한국인 체형에 맞는 신약개발에 큰 기여
• 한국인 유전체 데이터 기반의 생물정보 분석 수요의 확대 예상
질병관리본부 유전체센터 16.10.10
[이슈]
한국인 인체 유래 원시세포를 이용한 에피유전체 연구 동향
• 고령화를 대비한 맞춤의료 실현은 미래 대응을 위한 창조 연구와 보건의료 융복합 신기술 개발 등 국내 보건의료 연구의 중장기 비전에 부합하는 원시세포의 에피유전체 분야의 연구 동향
• 피유전체 연구에서 로드맵이 될 수 있는 참조유전체 데이터로써 원시세포의 에피유전체 지도작성에 관한 최신 연구 동향
국내 원시세포(primary cell) 관련 정책 및 연구 동향
• 보건복지부와 국립보건연구원에서 한국인체자원은행사업을 추진하고 있으며 소속 17개 인체자원단위은행과 중앙은행(충북 오송)을 통하여 현재 수집한 50만 명분 한국인 인체자원을 분양하고 한국인체자원은행사업(Korea Biobank Project)의 수요자 맞춤형 분양시스템을 구축하여 One-stop 분양이 가능한 온라인 분양 포털을 구축
1) 한양대학교 [에피유전조절에 의한 세포기능분석 연구센터]: 국가지정 과학연구센터(SRC)로 지정되어 에피유전체 연구자 간 협력 연구를 수행
• 2) 한국생명공학연구원 [유전체연구센터]: 줄기세포의 분화 관련 유전자의 동정 및 유전체 조절기전 규명, TM4SF4 유전자의 DNA methylation에 의한 발현조절 및 항-TM4SF4항체에 의한 암세포 성장억제 규명
• 3) 국립보건연구원 유전체센터 [형질연구과]: 국제인간에피유전체컨소시엄(IHEC)에 가입, 한국인 에피유전체 정보생산
해외 원시세포(primary cell) 연구 동향
• IHEC(International Human Epigenome Consortium)
• TCGA (The Cancer Genome Atlas)
[오피니언]
• 한국인으로부터 유래한 원시세포를 이용하여 한국인 특이적인 에피유전체적 정보를 생산하고, 이를 통하여 한국인의 질병 또는 질병에 대한 치료에 적합한 연구 데이터를 제공
• 국제적 컨소시움 참여를 통하여 유명한 연구기관과의 긴밀한 네트워크를 구축하고 각 기관과의 협업을 통하여 높은 질의 연구 성과를 기대
뉴스1 16.10.20
[이슈]
'실험동물' 아프리카발톱개구리 유전체 해독
• UNIST 연구진이 100여년간 실험동물로 각광받아온 ‘아프리카발톱개구리’의 유전체를 해독
• 아프리카발톱개구리의 유전체와 4만여 개의 유전체를 염색체 수준으로 규명하고 이를 20일 ‘네이처’에 발표
• 염색체 그룹이 4개(4배체)여서 분석이 까다로와 다른 동물보다 유전체 해독이 느렸음
• 권태준 교수는 “아프리카발톱개구리는 4개 유전체 그룹으로 이뤄진 독특한 동물이라 유전체 정보가 제한적으로만 알려져 있었다”며 “이번 유전체 해독으로 생물학 전반에 쓰일 효과적인 실험동물 모델 시스템을 구축할 수 있게 됐다”고 발표
• 아프리카발톱개구리는 4개 유전체 그룹에서 각각 9개의 염색체를 가지며 연구진은 이들 염색체의 DNA 반복서열을 분석해 크기가 큰 L염색체 9개와 크기가 작은 S염색체 9개가 각각 다른 종에서 유래했다는 것 밝혀냄
[오피니언]
• 암 등의 인간질병 연구하는 새로운 모델 기대
• 진화를 통해 새로운 유전자가 생성되는 과정과 같은 기초 연구뿐 아니라 암이나 선천성 기형처럼 배체수 변화가 흔히 나타나는 질병 연구에도 도움이 될 것
바이오 #
[이슈]
박근혜 대통령이 방한한 루터 네덜란드 총리와 정상회담을 열고 양국 간 협력 강화를 위해 양해각서 5건 체결
• 네덜란드가 강점을 가진 빅데이터와 바이오 분야의 협력 강화
• 네덜란드의 빅데이터 활용과 분석기법을 도입하면 속보성 경기동향 통계 작성이 가능해져 소비자심리지수와 GDP 선행지표를 매일 만들 수 있을 것으로 전망
• 인적·물적 교류를 활성화하기 위해 양국 간 투자 기업을 서로 지원하고, 두 나라 경제인 단체를 통한 민간경제협력위원회를 정례화
• 난 2년 동안 시험 운영돼온 워킹 홀리데이 프로그램을 공식화해 양국 학생들의 교류 범위를 늘리자는 데에도 뜻을 모음
• 농업인 교육 프로그램 등을 토대로 농엽 협력 분야를 스마트 농업으로 넓히기로 했음
[오피니언]
• 청와대는 양국 정상이 이번 만남을 통해 경제 협력 확대 말고도 대북 공조를 한 단계 강화하는 계기를 마련한것으로 밝힘
[이슈]
한국, '뇌지도' 연구 나선다
• 선진국들은 새로운 블루오션으로 '뇌지도'에 주목하고 있음, 1,000억개의 신경세포(뉴런)로 구성된 신경망을 밝히고 재구성하는 뇌연구 프로젝트에 전세계의 두뇌들이 모여들고 있음
• 4차 산업혁명의 핵심인 인공지능(AI) 개발에도 뇌연구는 필수
• 컴퓨터 및 소프트웨어 분야로 간주된 인공지능 연구의 발달도 뇌연구를 촉진시키고 있고, 인공지능(AI)의 궁극적인 지향점이 결국 인간의 '뇌'
• 뇌연구는 신경과학, 뇌질환, 뇌공학, 뇌인지 등 크게 4가지 분야로 나뉘는데 의학, 생리학, 공학, 인지심리학 등 여타 학문을 총망라함
• 우리 정부 지난 5월 향후 10년간 3400억원을 투입, 뇌연구의 기반 마련을 위한 '뇌과학 발전전략'을 세움
[오피니언]
• 선웅 고려대교수 우리 스스로 뇌지도 프로젝트 연구를 통해 2020년 이후 가시화될 선진국의 뇌연구 완성 시점을 쫓아가야 한다고 강조
• "미국은 10년간 게놈 프로젝트를 통해 140배의 경제 효과를 냈다"며 (뇌연구 분야에서) 우리도 가만히 있으면 정말 큰일 나겠다는 위기감이 크다고 표현
헬스통신 16.10.12
[이슈]
대학병원들, 미래 먹거리 사업에 헬스케어 지목
•의료계에 따르면 고려대학교 안암병원, 고신대학교 복음병원 등이 헬스케어 사업에 박차를 가하며 미래 신성장동력으로서의 가능성을 염두에 두고 있다고 발표
• 헬스케어 ICT융합 컨소시엄 지원사업은 헬스케어산업과 정보통신 기술이 융합된 제품과 서비스의 기술개발을 지원하는 사업을 통해 더욱 헤스케어 산업 육성
• 주요 지정과제로 △한국의료기술 제공을 위한 PHR 기반의 원격의료 플랫폼 개발 △스마트 기반 진료의뢰 및 예약연동 진료협력 시스템 및 Web&App. 포털 개발 △생애주기별 질환 관리를 위한 해외수출용 컨텐츠 개발 △만성질환 관리를 위한 융합형 컨텐츠 SW/기기 개발 △글로벌 협진을 위한 클라우드 플랫폼 및 코호트 DB 구축 등 총 5가지로 오는 2017년 5월까지 연구 지원할 계획
• 이번 사업은 단순히 과제를 수행하는데 그치지 않고 고려대학교와 고려대의료원이 추진하는 KU-MAGIC 의료 연구개발의 중요한 과제이기에 연구중심병원으로서 중점 사업으로 추진할 것
• 고신대학교복음병원은 최근 원내 U헬스케어사업단이 아이쿱, 라이프사이언스테크놀로지(이하 LST), 가톨릭의대 U헬스케어사업단과 다자간 업무제휴 협약을 체결하고 본격 가동을 시작했다고 발표
• 의료기기 산업은 연 9%대로 빠르게 성장하고 있으며 특히 웨어러블과 원격진료 의료기기 부품은 연 50% 이상의 성장을 가져올 것으로 전망됨에 따라 부산의 의료산업 발전을 위한 ICT 헬스케어 생태계조성의 필요성에 따라 고신대복음병원은 올해 초 U헬스케어사업단을 출범
[오피니언]
• U헬스케어사업단 조경임 단장은 "헬스케어산업은 기대수명이 100세를 넘어서는 미래세대의 중요한 고부가가치산업"이라며 "이번 협약으로 ICT를 헬스케어산업에 접목한 연구 및 사업 수행으로 성장세인 헬스케어시장의 대표 아이디어로 자리매김하게 될 것으로 기대
• 부산·경남 지역 내에서 장애인 고빈도 이용시설과 의료기관과의 긴밀한 협조 체계 구축으로 디지털헬스케어의 유효성과 안전성을 규명할 수 있는 기반을 마련하는 것과 함께 장애인의 의료접근성과 건강추구권 보장을 위한 의료기술 및 정부정책 발전을 위한 시범사업 진행에 한층 속력이 붙을 전망
약사공론 16.10.20
[이슈]
신약개발, 국가적 컨트롤타워 통한 거시적 전략 필수
• 김선영 서울대 생명과학부 교수는 20일 오전 7시30분 국회 의원회관에서 열린 대한민국 미래혁신포럼·한반도선진화재단 주최 10월 제3차 정례포럼에서 "국내 신약개발 미래전략은 어떠해야 하는가?" 질문에 대해 답
• "우리나라의 경우 지원이 없는 나라이기 때문에 지식기반 산업을 통해 미래를 준비할 수밖에 없다"면서 "지식기반 산업에서 의약산업은 우리의 먹거리로 주목해야 하는 분야"라고 밝히고 국내 신약개발의 중요성과 그 방향을 설명
• 원천 물질 혹은 기술 특허가 부족이 국내 신약개발의 가장 큰 제한요인으로 꼽았고, 또한 미국의 경우 신약개발 초기단계를 주도하는 그룹들은 START-UP 회사라며 이의 활성화가 부족하다고 진단
• 선진국 수준의 생산 설비 등 하드웨어 및 소프트웨어 부족과 글로벌 성공사례 부족으로 인한 자신감 결여가 문제점으로 지적
• 무엇보다 국가적 차원의 지원이 필요하다고 강조했다. 정부가 컨트롤타워로서의 주도적 역할을 통해 중장기적, 거시적 전략을 세워 신약개발을 추진해야 한다고 제안
• 국가적 차원의 성공에 필요한 요인으로 기업과 정부의 전략과 집행이 거시적 전략과 분야선정과 포트폴리오, 조직 등 구체적 실천 계획이 있어야 한다고 역설
• 코스닥이나 코넥스, VC, 엔젤, M&A 등을 통해 기업의 연구개발 투자 환경을 만들어줘야 한다고 제시
• 전세계 인구의 25%, 한·중·일 GDP 합이 미국의 94%, 송도 및 김포에서 중일 주도 도시가 2시간(1일 생활권)이라는 특성을 살리는 개방 혁신이 필요
[오피니언]
• 정부지원, 투자연계, 중장기계획 수립, 지식기반의 사업에 대한 근본적이고 원론적인 표현은 있었지만 구체적인 대안은 부족했다는 의견
산업/정책 #
전자신문 2016.10.11
[이슈]
갤럭시노트7 단종…국내 경제 악영향
• 삼성전자가 갤럭시노트7 단종을 결정, 발화 원인을 파악해 재판매를 하더라도 사태 해결이 어렵다는 판단을 한 것으로 풀이
• 홍채인식 등 최신 기술로 화려하게 등장한 갤럭시노트7은 출시 두 달도 안 돼 역사 속으로 사라지는 비운의 스마트폰
• 삼성전자는 문제점을 발견해 수정하고 새로운 제품을 판매하더라도 사태 수습이 불가능하다고 결론
• 오랫동안 신규 부품을 연구개발하고 생산한 업체는 판매선 확보와 재고 처리 우려가 커지고 있고, 홍채인식 기반 금융권 핀테크 확산도 주춤
• 국내 경제에도 먹구름이 드리워짐, 지난해 갤노트5 출시로 9월 반도체 생산이 17.2%, 전체 산업 생산이 54개월 만에 가장 큰 폭(2.4%)의 증가세를 보였으나, 자동차·철도 파업에 악재가 겹치며 청와대 고심이 깊어짐
[오피니언]
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• 통인업계 관계자, "소비자 신뢰 회복이 가장 중요하다”면서 “신속한 후속 조치가 이어져야 한다”며 충격의 일단을 내비침
• 삼성전자는 이번 사태를 더 완성도 높은 제품을 만들 수 있는 계기로 삼아야 할 것
생물정보교육 #
제 34회 KOBIC 차세대 생명정보학 교육
[주제]
R 기초교육 및 유전체 데이터 분석 실습
[일정]
2016년 10월 20일(목) ~ 21일(금)
[장소]
KT인재개발원 1연수관 202호
생물정보 솔루션 및 人Co 워크샵 안내 #
CLC Main Workbench 구매
[소식]
생.기.다. 프로젝트 - 5. Phylogenetic Tree 완전정복!_CLC Main Workbench 편
[내용]
• 생물정보 분석을 위해 최적의 환경과 지속적 온/오프라인 지원 및 커뮤니케이션 제공을 위한 생물정보 기초 다잡기 프로젝트(생기다) 진행
• 생물의 진화연력을 기반으로 계통 분류를 하 는 Phylogenetic Tree 를 그리는 방법에 대한 포스트 (CLC Main Workbench)
NEBION, Genevestigator의 인기있는 3개 tool이 무료!
[제목]
2016년 10월 31일까지, GENEVESTIGATOR Professional의 3가지 인기 tool을 무료로 이용
[내용]
• 3가지 tool을 이용하여 관심있는 유전자와 함께 조절되는 유전자들을 찾습니다. 워크플로우는 아래와 같습니다.
• Perturbations tool 관심있는 유전자가 조절되는 특정 조건 검색
• Co-Expression tool 특정 조건에서 유사한 발현 패턴을 갖는 유전자 탐색
• Hierarchical Clustering tool 조직, 세포타입에 따라 동시에 발현되는 유전자들 그룹핑
Video Tutorial 보러가기
