Microbiome 용어정리

Taxa : 분류 (Linnaean taxonomy)

* Microbiome diversity:

1. Alpha diversity: 1개의 샘플내 분석 의미. richness와 eveness (distribution) 

    개체 수에 관계없이 얼마나 종의 수가 많은 가를 보는 지표 (참고) 

    다양성지수 : species richness, Chao1, Observed species, Simpson and Shannon 등 

2. beta diversity: 샘플간의 유사성, 차이점을 보여줌 (얼마나 비슷한지?) 

3. Gamma diversity: 생태계의 총 종 다양성

OTU (Operational Taxonomic Unit): DNA시퀀싱 결과에서 유사한 시퀀스들을 종들끼리 묶는 분류단위 (diversity 분석시 사용)

출처: https://m.blog.naver.com/PostView.naver?blogId=naturelove87&logNo=222051219527&targetKeyword=&targetRecommendationCode=1

https://m.blog.naver.com/PostView.naver?blogId=naturelove87&logNo=222051853490&targetKeyword=&targetRecommendationCode=1 

http://www.incodom.kr/operational_taxonomic_unit 

https://biomcare.com/info/key-terms-in-microbiome-projects/