[리서치] 코로나 염기서열 시청각화 #1

rna

https://www.genome.gov/genetics-glossary/messenger-rna

Messenger RNA (mRNA)

rna dna 차이

https://blog.naver.com/PostView.nhn?blogId=sanigen&logNo=221302752800&parentCategoryNo=&categoryNo=70&viewDate=&isShowPopularPosts=true&from=search

DNA와 RNA의 차이 (RNA world)

http://scienceon.hani.co.kr/408066

‘DNA 접힘의 역학이 중요한 이유’ -시뮬레이션 연구

https://ko.wikipedia.org/wiki/%EA%B2%8C%EB%86%88

게놈 - 위키백과, 우리 모두의 백과사전

게놈(독일어: genom, 영어: genome 지놈[*]) 또는 유전체(遺傳體)는 한 개체의 모든 유전자(진핵생물의 경우 엑손+인트론)와 유전자가 아닌 부분(반복서열 등을 포함)을 모두 포함한 총 염기서열이며, 한 생물종의 완전한 유전 정보의 총합이다. 게놈은 보통 DNA에 저장되어 있으며 일부 바이러스에는 RNA에 있다. ‘게놈’이라는 낱말은 유전자(Gene)와 염색체(chromosome)에서 유래하였으며, 1920년 함부르크 대학교의 식물학 교수 한스 빙클러가 만든 말이다. 한국어권에서는 최재천이 '유전체'라는 용어를 제안하였다. 유전학에서 나온 학문인 유전체학에서 유전체를 연구하는데, 생정보학 기술이 많이 필요하기 때문에 정보과학 분야로 이전된다고 지적된다. 유전체학과 함께 단백체학, 전사체학 및 상호작용체학 등이 연구되고 있다.

https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%97%BC%EA%B8%B0%EC%84%9C%EC%97%B4

염기서열 - 위키백과, 우리 모두의 백과사전

염기서열(Nucleic Sequence, 鹽基序列) 또는 핵산의 1차 구조(Nucleic Acid Primary Structure)는 DNA의 기본단위 뉴클레오타이드의 구성성분 중 하나인 핵염기들을 순서대로 나열해 놓은 것을 말한다.

https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%89%B4%ED%81%B4%EB%A0%88%EC%98%A4%ED%83%80%EC%9D%B4%EB%93%9C

뉴클레오타이드 - 위키백과, 우리 모두의 백과사전

뉴클레오타이드(nucleotide) 또는 뉴클레오티드는 핵산을 구성하는 단위체인 분자이다. 덧붙여, 뉴클레오타이드는 대사(metabolism)에 중추적인 역할을 한다. 그 용량으로 인해 화학적 에너지의 공급자(ATP)이며[1], 세포내 신호계[2] 그리고 효소 반응의 중요성분으로도 작용한다.

https://www.laboratoryequipment.com/563002-Researchers-Reveal-Genetic-Map-of-COVID-19/

Researchers Reveal Genetic Map of COVID-19

https://www.ibs.re.kr/cop/bbs/BBSMSTR_000000000738/selectBoardArticle.do?nttId=18344

New Coronavirus (SARS-CoV-2) Mapped Out

https://www.assaygenie.com/seroconversion-in-covid-19-kr

https://m.post.naver.com/viewer/postView.nhn?volumeNo=27958888&memberNo=37571784&vType=VERTICAL

사스코로나바이러스-2 고해상도 유전자 지도 완성

https://blog.naver.com/eunyo20/221974558704

코로나19 환자 유전자 염기서열 분석..S, V, G 그룹 모두 확인

s,v,g  그룹별 비교를 해보자 

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1189488873

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?lvl=0&id=1508220

Taxonomy browser (Bat coronavirus)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid1508220[Organism:noexp]

Bat coronavirus (ID 54402) - Genome - NCBI

https://www.coronavirus.gov/

Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/sars-cov-2-seqs/

SARS-CoV-2 Resources

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/?term=corona+virus+group+g

corona virus group g - Protein - NCBI

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/?term=Severe+acute+respiratory+syndrome+coronavirus+2%5Borganism%5D+AND+protein_structure_direct%5BFilt%5D

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2[organism] AND protein_ - Protein - NCBI

https://mra.asm.org/search/coronavirus%252Bs%252Bgroup%252Bg%252Bgroup

Search Results | Microbiology Resource Announcements

kaggle data

https://www.kaggle.com/paultimothymooney/coronavirus-genome-sequence/data?select=MN908947.fna

Coronavirus Genome Sequence

biopython을 이용한 dna sequencing

https://medium.com/analytics-vidhya/demystify-dna-sequencing-with-machine-learning-and-python-bdbaeb177f56

Demystify DNA Sequencing with Machine Learning and Python

squiggle

https://squiggle.readthedocs.io/en/latest/index.html

Squiggle — Squiggle documentation

https://medium.com/analytics-vidhya/coronavirus-covid-19-genome-analysis-using-biopython-8b8cb1f4a041

Coronavirus COVID-19 Genome Analysis using Biopython

부정 선택을 이용한 DNA의 패턴 분류

https://www.dbpia.co.kr/journal/articleDetail?nodeId=NODE00617356&language=ko_KR

https://www.assaygenie.com/seroconversion-in-covid-19-kr

triplet code

https://alevelbiology.co.uk/notes/characteristics-of-the-genetic-code/

Characteristics Of The Genetic Code | A-Level Biology Revision Notes

A triplet code could make a genetic code for 64 different combinations (4 X 4 X 4) genetic code and provide plenty of information in the DNA molecule to specify the placement of all 20 amino acids. When experiments were performed to crack the genetic code it was found to be a code that was triplet. These three letter codes of nucleotides (AUG, AAA, etc.) are called codons.

dna->rna //  데이터레코드로서, 복사 , 시작-끝 지점만 dna 열어서 복사 

핵산 3개 + 아미노산 (triplet code // 코돈)

-> 단백질 생성 //단백질들 모여서 생명체, 단백질이 최소기능단위 , 그 아래는 데이터단위

-> 복사한 rna 폐기

http://study.zum.com/book/13176

유전 암호 : 학습백과zum

https://mdon.co.kr/news/article.html?no=27067

IBS가 밝혀낸 코로나19 유전자 지도의 의미